发放工资的当月，计算应交个人所得税。如果当月发放多次，应该合并计税，也就是第二次、第三次、第四次与前面首先合并计税，然后补差。个税不是计提的时候产生的，是发放的时候计算的。因此即便计提的时候没有考虑到多次发放产生的税费，次月也必须按照税法申报。税法是不管你是否按月发放工资的，税法只关注每月发放的合计数是否符合申报纳税数。
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公司通过银行代发工资，需要按实际工资额缴纳个税，是公司报税的时候自行申报，银行不会在代发工资的时候扣。一般来说，如果使用的是某银行代发工资，员工的银行卡也会是本地某银行的，而代发工资实际上就是一种转账行为（同行、同城），所以是不需要收取手续费的。
如果是多发的钱，应该退回，否则公司有可能提起仲裁或诉讼。当然，如果这笔钱应该是你的，能做出合理解释的，则无须退。事实上，在法律上有一种事实行为叫做'不当得利'。据《民法典》相关规定：'因他人没有法律根据，取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。'而工资多发的部分就是'不当得利'，员工作为受益人，对受害人也就是公司有返还财物的义务。
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