要与单位协商，如果主管部门同意，那是可以办理的。 停薪留职合同是指为了使特定职工有期限离岗停薪并保留职工身份，而由用人单位与该职工依法签订的，约定停薪留职期间双方相互权利和义务的合同。该合同产生于20世纪80年代，只适用于原固定职工，不适用劳动合同制职工。合同有效期一般不超过二年。其内容包括：停薪留职的时间、其间的工龄计算、是否继续享受劳保福利待遇、停薪留职人员是否应定期向原单位缴纳社会保险费等。期间职工不升级，不享受各种津贴、补贴和劳保福利待遇；因病、残而基本丧失劳动能力的可按退职办法处理。此合同需由职工提出书面申请，经企业批准后双方协商签订。职工作了停薪留职申请，却未经企业批准就擅自离职的，企业要按违反劳动纪律来做处理。签订该合同的劳动者继续保留原用人单位劳动者的身份,但不在原用人单位工作。原用人单位停止对劳动者工资的发放。
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事业单位实行人员聘用制度后，应通过聘用合同调整人事关系，不应实行停薪留职。受聘人员应当具备履行岗位职责的能力，能够坚持正常工作。因此现在事业单位不能办理停薪留职。 停薪留职合同是指为了使特定职工有期限离岗停薪并保留职工身份，而由用人单位与该职工依法签订的，约定停薪留职期间双方相互权利和义务的合同。该合同产生于20世纪80年代，只适用于原固定职工，不适用劳动合同制职工。
目前事业单位不可以停薪留职。需要注意以下问题：国务院相关规定表示事业单位实行人员聘用制度，不得实行停薪留职；事业单位工作人员年度考核不合格且不同意调整工作岗位，或者连续两年年度考核不合格的，事业单位提前30日书面通知，可以解除聘用合同。
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