如果员工按照用人单位的离职流程依法办理离职的，老板非法克扣劳动者的工资属于违法行为，劳动者可以到用人单位所在地的劳动监察部门进行投诉，也可以到用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护合法权益。如果劳动者自离的，劳动者因此给用人单位造成损失的，劳动者应当承担赔偿责任。《劳动合同法》第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
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单位不能随意克扣员工工资。但根据法律规定或劳动合同约定，可以代扣或扣除工资的，是合法的。 1、有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资： （一）用人单位代扣代缴的个人所得税； （二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用； （三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费； （四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。 2、因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定，从劳动者本人的工资中扣除。
如没有《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条的情形，劳动者没有按规定书面提前30日辞职的，公司可以主张其承担违约责任，给公司造成损失的，公司可以主张其承担赔偿责任。
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