在员工的行为符合《劳动合同法》第三十九条的情况下，是不考虑员工处于什么状态的，就算是孕期员工，单位都是可以按照此条辞退员工。连续旷工三天是属于严重违纪行为，单位是可以以此辞退该员工。按照自动离职处理。依据《劳动合同法》第三十九条劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反用人单位的规章制度的；（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；（六）被依法追究刑事责任的。
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女职工从怀孕到生产完毕期间的劳动权益都是受到劳动合同法保护的，在整个孕期公司不能无故辞退。劳动者有下列情形之一的，用人单位不得解除劳动合同： (一)从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的; (二)在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的; (三)患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的; (四)女职工在孕期、产期、哺乳期的; (五)在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的; (六)法律、行政法规规定的其他情形。
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