员工申请工伤认定，如果单位没有证据证明不是工伤，那么就应该认定为工伤，但是员工必须提供工伤认定申请书，劳动关系证明以及首次诊断记录。依据《工伤保险条例》第十八条提出工伤认定申请应当提交下列材料：（一）工伤认定申请表；（二）与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料；（三）医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。工伤认定申请表应当包括事故发生的时间、地点、原因以及职工伤害程度等基本情况。工伤认定申请人提供材料不完整的，社会保险行政部门应当一次性书面告知工伤认定申请人需要补正的全部材料。申请人按照书面告知要求补正材料后，社会保险行政部门应当受理。第十九条社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。职业病诊断和诊断争议的鉴定，依照职业病防治法的有关规定执行。对依法取得职业病诊断证明书或者职业病诊断鉴定书的，社会保险行政部门不再进行调查核实。职工或者其近亲属认为是工伤，用人单位不认为是工伤的，由用人单位承担举证责任。
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职工发生工伤事故时，用人单位应当采取措施使工伤职工得到及时救治。 对受伤较轻的，可以到本单位的内部医疗机构进行简单处理；但对伤情严重的，应当将伤者尽快送到附近有相应处理能力的医疗机构进行抢救。 用人单位应当依法及时向有关部门报告，否则要受到相应的处罚。 单位还应当积极配合员工申请工伤认定，职工发生事故伤害，所在单位应当自事故伤害发生之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。 提出工伤认定申请应当提交下列材料： （一）工伤认定申请表； （二）与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料； （三）医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。 工伤认定申请表应当包括事故发生的时间、地点、原因以及职工伤害程度等基本情况。
工伤认定单位不认时，单位员工收集相关的证明材料再向社保部门申请工伤认定。社会保险行政部门工作人员无正当理由不受理工伤认定申请，依法给予处分；情节严重，构成犯罪的，依法追究刑事责任。
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