一是企业购置机器设备、厂房的预付款或预付在建工程款等误记入“预付账款”.在实际会计核算中，对企业购置机器设备、厂房的预付款或预付在建工程款，许多财务人员不知道应该将其列支在“预付账款”还是“在建工程”或“工程物资”科目。他们认为只要是预付的各种款项，均应在“预付账款”科目列支，对“预付账款”科目含义存在误解。《企业会计制度》规定，预付账款科目核算企业按照购货合同的规定而预先支付给供应单位的款项。该科目属于流动资产类科目，用来核算购入存货时形成的预付款。而上述的采购机器设备、厂房的预付款项或预付在建工程款属于固定资产类核算的对象，应当根据其性质用“工程物资”或“在建工程”科目核算。 二是职工借支而预付的材料款误记入“其他应收款”科目。在会计实务中，企业采购部门人员借支去采购材料等货物时需要先付款，财务部门只持有采购人员的借条，发票和供货企业的收据在当月收不到，会计人员在做账时往往误用“其他应收款”科目核算预付材料款。一般情况下，和主营业务无关的业务都可以用“其他应收款”核算，而“预付账款”一般核算和主营业务有关的项目，如采购材料等。所以职工借支预付的材料款应记入“预付账款”而不是“其他应收款”科目。 三是资产负债表中的预付账款项目填列不正确。会计期末，财务人员在编制资产负债表时，往往容易将应付账款和预付账款合并计算，如将“预付账款”总分类账户的期末余额直接填列在资产负债表的“预付账款”项目中，这样计算不一定正确，因为总分类账户等于所属各个明细分类账户余额之和，而预付账款总分类账中可能含有应付账款明细账金额。 四是将房地产开发企业预付工程款和预付的土地使用权款误记入“在建工程”.在房地产开发企业日常核算中，个别财务人员没有考虑到房地产开发企业的特殊性，将预付工程款和预付的土地使用权款误记入“在建工程”科目或“工程物资”科目。对于房地产开发企业来说，其开发项目属于存货，其预付工程款和预付的土地使用权款应该使用“预付账款”和“开发成本”两个科目进行核算，而不是记入“在建工程”或“工程物资”. 五是“预付账款”长期挂账影响损益和税收。企业按购货合同预付货款后，由于有的供货单位不开发票，有的供货单位可能倒闭或撤消，有的未倒闭但时间达两年以上不可能开发票，财务人员不对这笔经济业务进行账务处理，致使预付账款长期挂账，影响当期损益。在这种情况下正确的处理是：如有确凿证据表明其不符合预付账款性质，或者因供货单位破产、撤消等原因已无望再收到所购货物的，应将原计人预付账款的金额转入其他应收款，并计提相应的坏账准备。
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一、是企业购置机器设备、厂房的预付款或预付在建工程款等误记入预付账款。 二、是职工借支而预付的材料款误记入其他应收款科目。 三、是资产负债表中的预付账款项目填列不正确。 四、是将房地产开发企业预付工程款和预付的土地使用权款误记入在建工程。 五、是预付账款长期挂账影响损益和税收
预付账款和应付账款的区别：概念不同。预付账款是指企业按照购货合同的规定，预先以货币资金或货币等价物支付供应单位的款项。通俗说来就是我方先给对方付款。这说明对方有一定的商业信用，只有我方先付款的前提下，才能得到想购买的货物；科目不同。预付账款是属于资产类的科目。简单来说，就是暂时存在别处的款项，在没有发生交易之前，钱的所属权还是你，所以属于资产。
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