用人单位无故辞退劳动者，并且克扣其工资的，劳动者可以申请劳动仲裁，要求用人单位支付违法辞退的赔偿金以及被克扣的工资。 如何申请劳动仲裁： 1、去当地人力资源和社会保障局（原劳动局）内的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁，立案时需携带：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份；相关证据复印件和证据清单2份；用人单位的工商登记信息（北京地区不需要提供登记信息）。 2、提交材料后，5个工作日仲裁委给予立案，然后给双方举证期，给对方答辩期；然后开庭审理，之后对你们双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书；劳动仲裁60天内结案；对于裁决书不服，劳动者可以起诉到法院； 3、申请劳动仲裁期间，不耽误劳动者去新单位工作。 《劳动法》第五十条工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。 《工资支付暂行规定》第十八条各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金： （一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的； （二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的； （三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。
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员工辞职如果单位克扣工资，员工可以选择双方自行协商解决，当事人在自愿的基础上进行协商，达成协议。 协商不成或者双方不愿自行协商的，可以进行调解，双方也可请愿申请企业调解委员会调解，对调解达成的协议自觉履行。 调解不成的可以申请仲裁。当事人也可直接申请仲裁。 另外，劳动者权益受到用人单位或非法职业中介机构等侵害时，还可以向劳动保障监察机构进行投诉处理。
公司克扣绩效工资可以投诉举报；申请劳动仲裁；打劳动保障热线12333投诉，这个电话全国统一，投诉时需要实名投诉，要提供本人的身份证号码、姓名。到当地力资源和社会保障局的劳动监察大队投诉。这些机构是专业处理劳资纠纷的。若公司可以说明不是克扣工资，是依法计算只是由于出勤、双方约下的奖金方面的原因而减发工资的，则以上机构是不会处理的。在这种情况下若认为公司确为克扣的，可以提起劳动仲裁。
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