员工擅自离职怎么处理，劳动者擅自离职是指其未向用人单位提出口头或书面辞职报告，而随意离开所在单位及其所担任的工作职务或岗位的违法违约行为。因此，用人单位应当在教育劳动者自觉守法、守约的同时还应依据《劳动合同法》第4条和第39条第2项的规定制定好内部规章制度，对劳动者擅自离职的行为作出限制性和处罚性的规定。这种违法的行为往往会给用人单位造成经济损失，因此用人单位还应依据《劳动合同法》第17条第2款和第90条的规定，在劳动合同中与劳动者约定针对擅自离职行为的损失赔偿条款，能计算出损失额的，可要求其按实际损失额赔偿，无法计算损失额的，可约定一个具体的索赔数额。还可依据该法第91条的规定，要求招用该擅自离职、尚未与本单位结束劳动关系的劳动者的用人单位承担连带赔偿责任。
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辞职后用人单位是无权扣留离职员工档案的。用人单位与劳动者解除劳动合同后，应当在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
经济补偿：公司确属无故开除的，无个人原因，单位应当支付经济补偿，工作每满一年支付一个月工资，半年以上不满一年按一年算，半年以下按半年算，支付半个月工资。赔偿金：公司无正当理由开除员工属违法解除，应当支付赔偿金，赔偿金的标准是经济补偿的二倍，包含经济补偿。如果未签合同，应当每月支付二倍工资，一般都是11个月，除去已支付的工资。
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