虽然假冒他人专利与专利侵权都是违法行为，但它们之间是有区别的，主要表现两个方面：第一专利侵权是指未经专利权人许可实施其专利的行为，关键在于侵权人实施了专利权人的专利。而假冒他人专利主要是指使用他人专利标记或者专利号的行为，并不涉及对专利权人专利的实施。专利侵权行为侵犯了专利权人的合法民事权益，行为人应当承担民事责任。专利行政机关可以应当事人的请求，就侵犯专利权的赔偿数额进行调解，调解不成的，当事人可以向人民法院提起民事诉讼，当然，当事人也可以直接向人民法院起诉。专利侵权纠纷主要通过民事途径解决，专利管理机关只能在认定侵权行为成立时，作出责令侵权人停止侵权行为的行政决定。假冒他人专利行为一方面直接影响了被假冒的专利权人信誉，损害了专利权人的利益，属于民事侵权行为，行为人应当承担民事责任。假冒他人专利行为情节严重的，还可能涉嫌假冒专利罪，要被追究刑事责任。

一、《中华人民共和国专利法》中的相关规定

(1)未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求管理专利工作的部门处理。管理专利工作的部门处理时，认定侵权行为成立的，可以责令侵权人立即停止侵权行为，当事人不服的，可以自收到处理通知之日起十五日内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉；侵权人期满不起诉又不停止侵权行为的，管理专利工作的部门可以申请人民法院强制执行。进行处理的管理专利工作的部门应当事人的请求，可以就侵犯专利权的赔偿数额进行调解；调解不成的，当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民法院起诉。

(2)负责专利执法的部门根据已经取得的证据，对涉嫌假冒专利行为进行查处时，有权采取下列措施：

(一)询问有关当事人，调查与涉嫌违法行为有关的情况；

(二)对当事人涉嫌违法行为的场所实施现场检查；

(三)查阅、复制与涉嫌违法行为有关的合同、发票、账簿以及其他有关资料；

(四)检查与涉嫌违法行为有关的产品；

(五)对有证据证明是假冒专利的产品，可以查封或者扣押。

管理专利工作的部门应专利权人或者利害关系人的请求处理专利侵权纠纷时，可以采取前款第(一)项、第(二)项、第(四)项所列措施。

负责专利执法的部门、管理专利工作的部门依法行使前两款规定的职权时，当事人应当予以协助、配合，不得拒绝、阻挠。

二、企业如何保护专利权

可以通过《专利法》来保护自己的专利。遇到专利侵权的问题，可以协商解决或者诉讼解决。《专利法》第六十条规定，未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求管理专利工作的部门处理。管理专利工作的部门处理时，认定侵权行为成立的，可以责令侵权人立即停止侵权行为，当事人不服的，可以自收到处理通知之日起十五日内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉；侵权人期满不起诉又不停止侵权行为的，管理专利工作的部门可以申请人民法院强制执行。进行处理的管理专利工作的部门应当事人的请求，可以就侵犯专利权的赔偿数额进行调解；调解不成的，当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民法院起诉。