农村合作医疗不能补交。农村合作医疗每年缴纳时间为每年的11月份到12月份尾，生效时间为次年的1月1日，也就是说农民参加合作医疗必须在每年11－12月参保，次年补交只能在下一年才能生效。

一、新农合与职工医疗保险的区别

1、所覆盖的对象不同。职工医疗保险是城镇所有用人单位。新农合必须是有农村户口才可以办理。

2、缴费主体不同。职工医疗保险是用人单位和社会成员个人共同缴纳医疗保险费，建立医疗保险基金。新型农村合作医疗制度是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资。

3、缴费方式不同。职工医疗保险具有强制性，是单位和职工共同缴纳的，并需要缴纳时间达到一定的年限。新型农村合作医疗是农民自愿参加，而且必须以家庭为单位整户参加，且需要每年办理参保缴费手续。

4、缴费标准不同。职工基本医疗保险缴费和个人工资有关，按照相关规定的比例标准缴纳。新型农村合作医疗的缴费标准有每年100元、200元、300元、400元、500元，各个地方根据自身的情况来设置缴费的档次。

5、报销比例不同。职工基本医疗保险参保人拥有个人账户，定期会有费用划入，报销比例较高。新型农村合作医疗没有个人账户，报销比例也比职工基本医保要低。

二、农村医保停了能恢复吗

可以。新农合全名叫做新型农村合作医疗，其实就是农民的医保，看病住院就可以通过它来报销。费用也不贵，大部分地区，每年都只用交200左右。另外，缴费时间一般在9-12月，同样的，如果停缴职工医保，想重新缴纳新农合，也是在这个时间点去缴费，享受次年的新农合医保待遇。很多地方，村委会都会上门通知，同时把钱也一起收了，这个是最方便省事的，大家尽量用这种方式缴。没有通知到的，也可以自己问问家里人或者村委会。当然，要是不小心错过了村委会统一收取时间，有的地区其实也可以网上缴费，不过缴费前要先打12333社保电话问下在哪交，有的是在社保官网，有的在支付宝上。

三、怎么退合作医疗再申请交五险

合作医疗一旦缴纳，在一年内是退不了的。

如果下一年想参加单位五险一金，不参加农合了，可以在农合缴费的时候（一般在10月份-12月份缴纳下一年的农合费用），不缴纳自己的那份钱就可以了，下一年农合就自动的停止。

实际上，虽然报销时五险一金中的医疗保险和农村合作医疗是冲突的，二者只能选择一个保险，但二者（缴纳费用）应该是可以同时都参加的。也就是说，你交五险一金和家里有没有农合，应该没有影响，住院报销时用公司的医疗保险就好了~

没有必要费劲的还要退合作医疗，过年不交农合钱就是了。