非法运营车辆发生交通事故，并不是保险公司不予赔付的除外责任，保险公司应该按照保险合同理赔。非法营运车辆出了交通事故，保险公司会按合同约定项目内容和金额赔偿。根据交强险条例保险公司不予赔付的情形为：（一）驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；（二）被保险机动车被盗抢期间肇事的；（三）被保险人故意制造道路交通事故的。

非法营运车辆发生交通事故的责任

非法营运车辆发生交通事故的责任判定如下：1、非法营运并不意味着一定会导致交通事故的发生；2、此外，非法经营和交通事故侵犯的法律利益是不一样的；3、因此，在非法运营车辆在交通肇事中在事故责任认定中与普通车辆一样，只追究其对违章道路交通安全法的责任，非法运营是运管部门进行处罚管理的，与交通事故处理无关。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。道路交通事故的损失是由受害人故意造成的，保险公司不予赔偿。