二者的主要区别在于：

(1)犯罪主体不同。前者是国家工作人员；后者是公司、企业或者其他单位中除国家工作人员以外的其他工作人员。

(2)犯罪客体不同。前者侵犯的是公务行为的廉洁性和公款的部分所有权；后者侵犯的是公司、企业或者其他单位的资金的部分所有权。

(3)犯罪对象不同。前者只能是公款和用于救灾、抢险、防汛、优抚、扶贫、移民、救济的款物；后者不仅包括国有、集体公司、企业或者其他单位的资金，也包括私营公司、企业或者其他单位的资金。