二者的主要区别是：

一是行为的主体不同，检举人一般是与违纪案件没有直接关系的人，既不是同案人，也不是被害人；而控告人则是直接或间接的受害人，或是受害人的法定代理人及共亲属等。二是行为的目的不同，检举一般是出于义愤或为了维护公共利益；而是控告一般是为了保护自己的权益。

律师代理控告人进行控告的权限

第一，侦查人员在办案中违反法律规定，侵犯犯罪嫌疑人的人身权利。

《刑事诉讼法》

第五十二条审判人员、检察人员、侦查人员必须依照法定程序，收集能够证实犯罪嫌疑人、被告人有罪或者无罪、犯罪情节轻重的各种证据。严禁刑讯逼供和以威胁、引诱、欺骗以及其他非法方法收集证据，不得强迫任何人证实自己有罪。必须保证一切与案件有关或者了解案情的公民，有客观地充分地提供证据的条件，除特殊情况外，可以吸收他们协助调查。

第二，侦查人员在办案中违反法律规定，侵犯犯罪嫌疑人的诉讼权利。

人民法院、人民检察院和公安机关应当保障诉讼参与人依法享有的诉讼权利。在侦查阶段，犯罪嫌疑人所享有的诉讼权利主要有：

(1)有使用本民族语言文字进行诉讼的权利；

(2)有获知所享有的诉讼权利的权利；

(3)有聘请律师的权利；

(4)有拒绝回答与本案无关的问题的权利；

(5)有申请侦查人员回避的权利；

(6)有要求对超过法定期限的强制措施进行解除的权利。如果律师认为犯罪嫌疑人的以上权利被侵犯，律师也可以代理犯罪嫌疑人向有关部门提出控告。

第三，侦查人员在办案中违反法律规定，侵犯犯罪嫌疑人的其他合法权益。