司法鉴定人进行医疗纠纷鉴定的程序如下：

1．对委托人的委托事项进行审核，作出是否受理的决定；

2．受理案件后，应当指派具有社会专业司法鉴定资格的人员承担鉴定工作；

3．需要补充鉴定的，司法鉴定机构接受委托进行补充鉴定；

4．出具司法鉴定文书。

不得作为司法鉴定人的情形

不得作为司法鉴定人的情形有：

1．因故意犯罪或者职务过失犯罪受过刑事处罚的；

2．受过开除公职处分的；

3．被司法行政机关撤销司法鉴定人登记的；

4．所在的司法鉴定机构受到停业处罚，处罚期未满的；

5．无民事行为能力或者限制行为能力的；

6．法律、法规和规章规定的其他情形。

《司法鉴定程序通则》第十八条

司法鉴定机构受理鉴定委托后，应当指定本机构具有该鉴定事项执业资格的司法鉴定人进行鉴定。

委托人有特殊要求的，经双方协商一致，也可以从本机构中选择符合条件的司法鉴定人进行鉴定。

委托人不得要求或者暗示司法鉴定机构、司法鉴定人按其意图或者特定目的提供鉴定意见。

第十九条

司法鉴定机构对同一鉴定事项，应当指定或者选择二名司法鉴定人进行鉴定；对复杂、疑难或者特殊鉴定事项，可以指定或者选择多名司法鉴定人进行鉴定。