公司自行破产清算有法律效果。根据《公司法》规定；公司自行解散；应由股东或股东大会确定的人选组成清算组。清算组在发现公司财产不足清偿债务时；应向法院申请宣告破产。

此外；进入有限公司清算程序时；应依据《公司法》的规定；在清算期间；有限公司存续；但不得开展与清算无关的经营活动。根据新《破产法》第三十三条规定：涉及债务人财产的下列行为无效：(一)为逃避债务而隐匿、转移财产的；(二)虚构债务或者承认不真实的债务的。