不会的，依照法律规定，派出所已经立案的仍然会将案件移送检察院审查起诉，然后检察院向法院提起公诉，检察院认为情节轻微的，也可以不起诉。当事人之间达成调解协议或者和解协议，属于从轻处罚情节；对于检察院不起诉的，因是无罪处罚，不会留案底，如果派出所未刑事案件立案，而立的是治安案件，派出所调解后就有可能不移送起诉了，就不会有案底。

如果刑事和解会有案底吗

如果是自诉案件，即是指不经过公安机关或者检察机关，由被害人或其法定代理人，向法院提起诉讼，由法院直接受理的，轻微的刑事案件。和解后原告撤回起诉，案件没有经过法院实体审判，不会被判刑，也就不会留有案底。

如果是公诉案件，对于达成和解协议的案件，公安机关可以向人民检察院，提出从宽处理的建议；人民检察院可以向人民法院，提出从宽处罚的建议。所以，刑事和解后也是需要判刑的，这样会留有案底。

而对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚，达成和解协议的案件，检察院可以作出不起诉的决定。那就不用经过法院的审判，自然也就不会被判刑，不会留有案底。

《刑事诉讼法》第二百八十九条：“和解协议的审查与制作，双方当事人和解的，公安机关、人民检察院、人民法院应当听取当事人和其他有关人员的意见，对和解的自愿性、合法性进行审查，并主持制作和解协议书。”第二百九十条：“和解协议的效力，对于达成和解协议的案件，公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议。人民检察院可以向人民法院提出从宽处罚的建议；对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民法院可以依法对被告人从宽处罚。”