最高法院《关于审理涉及农村土地承包纠纷案件适用法律问题的解释》第十四条规定，承包方依法互换土地承包经营权，发包方仅以该土地承包经营权流转合同未报其备案为由，请求确认合同无效的，不予支持。

《农村土地承包法》第三十八条也规定，土地承包经营权采取互换方式流转，当事人要求登记的，应当向县级以上地方人民政府申请登记。未经登记，不得对抗善意第三人。

以上是我国法律对于土地承包经营权互换协议的法律效力的相关规定，通过以上内容我们可以了解到土地承包经营权互换协议只要是双方自愿签订，在不违背法律强制性规定的情况下就是有效的，且不以登记为生效要件，不过未经登记的不得对抗善意第三人。但是协议作为一种法律文书，有其必备的专业性，因此对于协议的起草还是请律师协助更为稳妥。

一、交换土地遇征地补偿该如何处理

双方可以协商处理。

该条款明确了土地承包经营权的公式对抗主义，登记对抗善意第三人。也就是说，双方对互换土地原享有的承包权利和承担的义务相应互换，当事人可以要求办理农村土地承包经营权证变更登记手续。不登记，不影响土地承包经营权的变更。但是在遇到征地后，没有到村委会办理变更手续的话，补偿款由原承包户获得。当然，如果办理了变更手续，补偿款就由变更后的权利人享有。

所以，为了完整的享受土地权利，互换土地承包经营权的农民们，一定要去村委会申请办理变更登记手续，以避免不必要的纠纷和损失。

二、土地承包经营权可以转让不

可以依照法律规定转让。

《民法典》物权编第334条规定：土地承包经营权人依照法律规定，有权将土地承包经营权互换、转让。未经依法批准，不得将承包地用于非农建设。

当事人在进行土地承包经营权互换、转让时，建议根据《民法典》第335条规定向登记机构申请登记。未经登记的，不得对抗善意第三人，当事人权益可能因此受损。

《民法典》第335条规定土地承包经营权互换、转让的，当事人可以向登记机构申请登记；未经登记，不得对抗善意第三人。