企业股权转让有关所得税《国家税务总局关于企业股权转让有关所得税问题的补充通知》(国税函[2004]390号)一文，主要针对企业股权转让的涉税问题进行以下三方面的明确：

一、股权转让人应分享的被投资方累计未分配利润或累计盈余公积应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质所得。

二、企业进行清算或转让全资子公司以及持股95%以上的企业时，投资方应分享的被投资方累计未分配利润和累计盈余公积应确认为投资方股息性质所得，在计算投资方的股权转让所得时，得以从转让收入中减除。

三、企业清算或转让子公司(或独立核算的分公司)的全部股权时，被清算或被转让企业应按过去已冲销并调增应纳税所得的坏帐准备等各项资产减值准备的数额，相应调减应纳税所得，增加未分配利润，转让人(或投资方)按享有的权益份额确认为股息性质所得。

[评述]

此文出台主要是为了避免对企业从被投资企业取得的利润双重征税。

举例言之：根据现行税收政策，如A投资于B，且A、B税率同为33%，股息性所得不交税。如A为33%，B为15%，则只需按18%(33%—15%)交税。

而若界定为股权转让所得，则应全额并入企业应纳税所得额。如，取得股权时以100万购入，转让时以120万卖出，则20万应全额交税。从本文件来看，先分配股利再转让股权对企业非常有利。

根据第二点，如企业进行清算或转让全资子公司以及持股95%以上的企业时，就没有必要进行这种筹划。

同时也说明，企业在清算前或转让前所持子公司股份未及95%，要探讨是否有可能先收购足够股份至95%以上再行清算、转让，因为此举可能为企业节省巨额税款。

第三点是针对企业会计制度与税法规定的不同而可能形成的时间性差异而定。这部分准备在会计上企业不作为税后利润，不可能分配给股东，但从税务角度，可以作为税后利润分配给股东。文件把转让企业或投资企业应享有的这部分权益也界定为从被清算、被转让企业分配的股息性所得，对企业来说是有利的。