1、户籍问题，在北京、上海等大学毕业生、外来务工人员数量众多的城市，多数新就业人员并非本地户籍人口。然而，受保障能力和管理水平所限，多数城市的公共租赁房仍然只保障本地户籍人口。能否突破户籍这道“门槛”，是公共租赁房能否实现“全兼容”的一个难题。由于目前公共租赁房资源不够，无论是低收入家庭还是新就业人员，保障的门槛还是比较高，房源布局也存在不合理的问题。

2、居住面积，国务院总理温家宝2011年9月19日主持召开国务院常务会议时，研究部署了进一步做好保障性安居工程建设和管理的工作。会议要求，继续大力推进保障性安居工程特别是公租房建设，加快实现住有所居的目标。公租房面向城镇中等偏下收入住房困难家庭、新就业无房职工和在城镇稳定就业的外来务工人员，以小户型为主，单套建筑面积以40平方米为主，只能适应人口较少的家庭居住。

3、租金标准，公共租赁房目的是让中低收入的住房困难家庭解决住房问题。但一些地区并没有因此解决住房问题。湖北省武汉市洪山区的武汉首批试点公租房2012年3月5日开始入住，这批公租房共有899套，但经审核获得资格的317户中却有1/3放弃了资格，目前(截止到2012年3月23日)实际入住的仅有210户。而调查显示房租偏高仍是住户面临的主要问题。一些住户反映800元的房租和100元的交通费用仍然让他们无力承担。

关于公租房

公共租赁房(简称：公租房)是对住房困难人群的过渡性的解决方案，旨在为不属于低收入人群但住房困难的人员，提供住房帮助。公共租赁房不归个人所有，而是由政府或公共机构所有，用低于市场价或者承租者承受起的价格，向新就业职工出租，包括一些新的大学毕业生，外地迁移到城市工作的群体。