首先在面对公司被告专利侵权这时候应该找专业的人分析一下是否真的侵权。如果分析后确定侵权或者侵权概率很大，那么可以考虑和解或者考虑看能不能无效对方所拥有的专利。如果分析后认为并不侵权那么直接应诉就可以了

在专利侵权诉讼中，一方当事人主张该专利为现有设计的，可在一审、二审中提供证据以支持其抗辩主张，此证据属于新证据，应作为认定案件事实的依据之一。

对于专利侵权案件，如果选择被告的住所地起诉，往往会受到地方保护主义的干扰。按照最高人民法院的司法解释，向侵权行为发生地有管辖权的法院起诉是一个很好的选择。另外，根据具体案情，并结合起诉对象的不同可选择最佳的起诉地点，从而有效保护自己的合法权益。