总公司注销分公司也要注销。因为分公司属于总公司分支机构，在法律上、经济上没有独立性，不具有企业法人资格，仅仅是总公司的附属机构，所以总公司注销了分公司也要随之注销。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。

总公司下的分公司怎么注销

根据《公司登记管理条例》（２０１４）第四十九条规定，公司决定撤销分公司的，应当自决定作出之日起３０日内向该分公司的公司登记机关申请注销登记。办理分公司注册登记的，需要提交以下材料：公司法定代表人签署的注销登记申请书和分公司的《营业执照》。

《中华人民共和国公司法》第十四条公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。

公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。