查办商业贿赂案件应采取以下对策。

主动深挖案源，提高案件查办效能。

一是拓宽执法领域，如上海市工商局金山分局今年查办的上海某水务公司商业贿赂案，其案件线索来源于2013年查处的水利建设违规系列案件；

二是形成执法合力，商业贿赂涉及多个领域和行业，隐蔽性强，单单依靠工商部门很难取证。

因此，工商部门在掌握初步证据后，应加强与当地纪检监察、公安、检察院等部门的沟通协作，建立信息互通、资源共享、密切协作、优势互补的工作机制。

加强沟通交流，提升案件查办水平。

一是结合具体案例，加强查办商业贿赂专业知识的培训，强化对行业规则、经济知识、法律法规的灵活运用，提高执法人员的发现案件能力、调查取证能力和现场处置能力；

二是加强科队联动，如在上述上海某水务公司商业贿赂案的查办中，上海市工商局金山分局积极请示上级机关，从案件定性、自由裁量、违法所得、处罚尺度等方面一一分析，逐一突破，及时确定了办案主攻方向。

积极引导规范，有效提升办案效果。

一是注重坚持处罚力度与违法行为相适应，在执法办案中做到案件查处的法律效果与社会效果的统一、打击违法与规范行业的统一、执法办案与服务发展的统一；

二是区分责任类别，应根据经营者实际情节的轻重，分清索贿与被迫行贿、主动行贿与受贿的责任，重点打击利用优势地位索取贿赂、以排挤竞争对手为目的的贿赂行为，维护公平竞争的市场秩序。