处罚肢解发包的方式是：建设单位将建设工程肢解发包，已形成违法事实，初次违法，能够限期改正，没有形成不良后果或消除不良后果的，责令改正，予以警告；建设单位将建设工程肢解发包，逾期未改正的，己造成危害后果的，责令改正，处工程合同价款0．5％以上0．65％以下的罚款；造成损失的，依法承担赔偿责任。肢解发包如何处罚的法律依据

《建设工程质量管理条例》第七十八条

本条例所称肢解发包，是指建设单位将应当由一个承包单位完成的建设工程分解成若干部分发包给不同的承包单位的行为。

本条例所称违法分包，是指下列行为：

（一）总承包单位将建设工程分包给不具备相应资质条件的单位的；

（二）建设工程总承包合同中未有约定，又未经建设单位认可，承包单位将其承包的部分建设工程交由其他单位完成的；

（三）施工总承包单位将建设工程主体结构的施工分包给其他单位的；

（四）分包单位将其承包的建设工程再分包的。