不会作废。用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。

一、离职不给停保单怎么办

向劳动部门申诉，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。

二、工作两年后辞职考研五险一金怎么处理

辞职后五险一金的处理方式是：

1、医疗保险和养老保险，停止交费，形成缴费年限中断，可以个人全额缴纳；

2、工伤保险、失业保险、生育保险，辞职后自动解除；

3、住房公积金，符合公积金提取规定可以提取，永远不会作废。

相关法律规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。

三、办了离职手续之后档案在哪儿

自动离职后，用人单位会办理档案转移。劳动者在新单位就业的，转移到新单位;没有在新单位就业的，转移到劳动部门的人才市场或者街道劳动保障所。

《劳动合同法》第五十条，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。