农村合作医疗和社保不可以同时申报。如两种医疗保险参与，只能享受待遇，因为基本医疗保险报销比例高于新型农村合作医疗保险，建议参加基本医疗保险后，新型农民停止，只参加基本医疗保险。根据《中华人民共和国社会保险法》的规定，国家建立健全城镇居民基本医疗保险制度，城镇居民基本医疗保险结合个人缴费和政府补贴，享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、60岁以上低收入家庭的老年人和未成年人，由政府补贴。

农村合作医疗和社保有冲突吗

1、农村合作医疗和社会保险中的医疗保险是有冲突的，不能同意享受这两项待遇。所以，没有必要同时参加。

2、可以根据自己的情况决定是否注销掉合作医疗。农村合作医疗每年交费一次，不产生个人账户余额，所以不存在转移费用的问题。

《中华人民共和国社会保险法》第二十五条国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。

城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。

享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。