根据我国相关法律规定，对于公司注册资金100万破产欠200万的情形，其所欠债款只能按照公司的全部资产进行赔偿，对于不足的部分，是不需要赔偿的。

一、公司破产债务怎么办的？

根据我国相关法律的规定，公司在破产之后进行破产清算。对于其公司债务要按照一定的顺序予以清偿，优先清偿所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；再者清偿所欠税款；再清偿普通破产债权。对于破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。

二、申请破产后个人债务怎么办

申请破产后个人债务的处理如下：

1、债务应当清偿，暂时无力偿还的，经债权人同意或者人民法院裁决，可以由债务人分期偿还；

2、有能力偿还拒不偿还的，由人民法院判决强制偿还；

3、永久无力偿还的，则只能用债务人的个人现有财产来清偿了，要经过法院审理、作出判决，再付诸执行。

一、不能强制执行的财产如下：

1、被执行人及其所扶养家属的家庭生活必需的物品；

2、被执行人及其所扶养家属所必需的生活费用；

3、被执行人及其所扶养家属完成义务教育所必的物品；

4、未公开的发明或者未发表的著作；

5、法律或者司法解释规定的其他不得查封、扣押、冻结的财产。

二、申请强制执行的条件如下：

1、申请执行的法律文书已经生效；

2、申请执行人是生效法律文书确定的权利人或其继承人、权利承受人；

3、申请执行人在法律文书生效两年内提出申请；

4、申请执行的法律文书有给付内容，且执行标的和被执行人明确；

5、义务人在生效法律文书确定的期限内未履行义务；

6、属于受申请执行的人民法院管辖。

三、企业破产清算债务怎么办

企业破产后，在偿还债务之前，应首先从公司财产中除去破产的费用，然后再用剩余的财产来偿还其债务。 当企业破产后的资产不足以偿还全部债务费用时，可以按比例进行支付破产费用。 破产人欠职工的工资，医疗，伤残和养老金费用，欠职工个人账户的基本养老保险和基本医疗保险费用，以及应当依法向行政机关支付的赔偿金优先赔付。