学校校车超载会被罚款并由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。

一、校车超员100%怎么处罚

驾驶超载100%的，驾驶证将被暂扣至违法状态消除，处五百元以上二千元以下罚款，记12分。然后持有大型客车、牵引车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证的一个记分周期内扣12分，驾驶人应当在受到交通违章处罚书后，15天内缴纳罚款，应当在30天内到交通管理部门办理降级业务。

二、车辆违规超载怎样处罚车辆超载和超限的区别

1)公路客运车辆载客超过额定乘员的，处200元以上500元以下罚款;超过额定乘员20%或者违反规定载货的，处500元以上2000元以下罚款。

2)货运机动车超过核定载质量的，处200元以上500元以下罚款;超过核定载质量30%或者违反规定载客的，处500元以上2000元以下罚款。

3)有前两款行为的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。

4)运输单位的车辆有本问第1),2)条的情形，经处罚不改的，对直接负责的主管人员处2000元以上5000元以下罚款。

三、货车超载百分之百怎么处罚？

根据规定如果货车载物超过核定载质量未达30%的，扣3分；载物超过核定载质量30%以上的，扣6分。所以货车超载百分之百扣6分，并处以五百元以上二千元以下罚款。由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。