与分公司签合同是可以仲裁总公司的，分公司对外签的合同，可以以总公司的名义起诉。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》第十四条公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。分公司不具有法人资格，因此分公司对外签的合同，起诉时，一般以总公司的名义起诉。但依据《民事诉讼法》第49条和《民诉意见》第40条，依法设立的分公司是“法人依法设立并领取营业执照的分支机构”，可以作为其他组织成为民事诉讼的当事人，具有诉讼资格。

一、分公司能独立订立施工合同吗

施工合同是可以委托分公司签订的。

公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由总公司承担。公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。分公司，在业务、资金、人事等方面受总公司的管辖，在法律上不具有法人资格，从根本属性上来讲，其属于总公司的一个分支机构。分公司虽然没有独立的财产和法人资格，但只要分公司经过工商部门的登记后，领取了营业执照，分公司可以作为《民事诉讼法》上的其他组织成为民事诉讼当事人。

总公司非依法设立分公司，或者虽依法设立，但没有领取营业执照，还是应当以设立该分公司的总公司为民事诉讼当事人。我们认为，分公司能否对外直接以当事人的身份参加到民事诉讼活动中，实质要以其是否领取了营业执照为要件，因为一旦分公司经过工商部门登记领取了营业执照，其对外便公示了分公司作为一个组织机构可以对外进行经营活动，因此其当然可以作为民事诉讼上的当事人参加民事诉讼活动。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》第十四条公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。

二、总公司与分公司的关系是什么

分公司是总公司下属的直接从事业务经营活动的分支机构或附属机构。分公司不具有企业法人资格，不具有独立的法律地位，不独立承担民事责任，其民事责任由总公司承担。

根据《公司法》第十四条规定，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。

公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。