1、在查处商标侵权案件过程中，对商标权属存在争议或者权利人同时向人民法院提起商标侵权诉讼的，工商行政管理部门可以中止案件的查处。中止原因消除后，应当恢复或者终结案件查处程序。

2、法律依据：《中华人民共和国商标法》

第六十二条县级以上工商行政管理部门根据已经取得的违法嫌疑证据或者举报，对涉嫌侵犯他人注册商标专用权的行为进行查处时，可以行使下列职权：

(一)询问有关当事人，调查与侵犯他人注册商标专用权有关的情况；

(二)查阅、复制当事人与侵权活动有关的合同、发票、账簿以及其他有关资料；

(三)对当事人涉嫌从事侵犯他人注册商标专用权活动的场所实施现场检查；

(四)检查与侵权活动有关的物品；对有证据证明是侵犯他人注册商标专用权的物品，可以查封或者扣押。

工商行政管理部门依法行使前款规定的职权时，当事人应当予以协助、配合，不得拒绝、阻挠。

在查处商标侵权案件过程中，对商标权属存在争议或者权利人同时向人民法院提起商标侵权诉讼的，工商行政管理部门可以中止案件的查处。中止原因消除后，应当恢复或者终结案件查处程序。

一、商标侵权有什么保护措施

商标侵权时采取的保护措施有：

(一)要注意对证据的收集。

因为只有在证据充足的情况下，才有利于行政执法机关或司法审判机关对某一行为是否是侵权行为尽快的加以认定。

(二)应该到专业的代理机构进行咨询。

专业人士会对案件进行初步的分析，并会对细节问题提供专业建议。

(三)制作投诉书或起诉书。

投诉书或起诉书的制作要注意将事实和语气有效地结合在一起，以利于案件的顺利进行。投诉书或起诉书是直接影响案件进程的最直接因素，建议委托专业人士来完成。

(四)被侵权人可以向县级以上工商行政管理部门要求处理。

有关工商行政管理部门有权责令侵权人立即停止侵权行为，赔偿被侵权人的损失，赔偿额为侵权人在侵权期间因侵权所获得的利润或者被侵权人在被侵权期间因被侵权所受到的损失。