瑕疵出资股东，对其股东权利限制的问题：自益权可在章程、股东会决议中限制；共益权中的表决权可做限制，除此之外的共益权不可做限制。

1、自益权限制问题：

股东自益权通常指公司盈余分配请求权、剩余财产分配请求权、股份转让权及请求收买股份权、股份转换请求权、新股认购权等财产权利；这部分股东权利，可以在公司章程、股东会决议中做出限制。

2、共益权限制问题：

股东共益权是指股东对公司事务的管理权和对公司机构的监督权，包括：出席股东会权、召集股东会权、表决权、股东会决议无效请求权、知情权等。

共益权是自益权实现的途径和保障，自益权是共益权行使的动力和目的。

《公司法》司法解释对自益权的限制问题赋予公司章程与股东会决议，对共益权的限制问题，仅就表决权有基于“公司自治”原则，在公司章程中可以对股东表决权进行限制。

除股东表决权外，股东其它共益权是否也可以在公司章程、股东会决议中予以限制？

股东表决权有双重属性，在公司章程和股东会决议中予以限制有比较趋同的看法。

陶律师认为，除表决权外的股东共益权，基于属于股东固有权利，基于股东身份而享有的，是否限制是理论争议很大的问题。

譬如股东知情权，则有裁判文书在法律说理中明确仅与股东身份密切相关，与股东是否实际出资以及是否足额出资不具备紧密联系，从而强调股东共益权不应被限制。

股东瑕疵出资能否影响股东行使权利

股东权利的行使是以是否具备股东资格为前提的，而非以股东是否实际出资为前提，瑕疵出资并不必然影响股东权利的行使。但是经公司催告缴纳或者返还，其在合理期间内仍未缴纳或者返还出资，公司可以以股东会决议解除该股东的股东资格。

《公司法》第二十八条，股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东以货币出资的，应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户；以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。

股东不按照前款规定缴纳出资的，除应当向公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。