虽然两者申请注销营业执照的方式不同，但法律后果不同。这是企业合法退出市场的必由之路。它不仅是投资者和股东的合法权利，也是他们必须履行的法律义务。吊销营业执照是工商行政管理机关根据有关法律、法规的规定，对存在严重违法违规行为的企业作出的最严厉的行政处罚。吊销营业执照，意味着企业法人资格被强制剥夺，其民事主体资格和经营资格将消失，企业不得继续从事市场经营活动。

营业执照被吊销后如何办理注销手续

营业执照被吊销之后要到原审批机关办理注销手续。注销的程序如下：

首先，要在地市级以上的报纸上刊登注销公告，申明公司要办理注销，不再经营。同时公司要成立清算小组，对其内部债权债务、税款、职工工资等情况进行清算，并出具清算报告。清算小组成员要到所在地工商管理部门进行登记备案手续。接下来，就可以依此办理国地税、工商和代码证的注销手续了。其中工商注销一定要在刊登注销公告45个工作日之后方可进行。

因未参加年检被吊销营业执照的公司办理注销登记时，应一并办理解除法定代表人警示限制手续。提交文件、证件如下：

1、《企业注销登记申请书》，注销原因注明“因未参加年检依法被吊销营业执照，申请办理注销登记。申请解除法定代表人的警示限制”；

2、股东会决议或决定；

3、法定验资、审计机构出具清算审计报告。报告中应载明下列事项：

（1）债权、债务已清理完毕；

（2）各项税款、职工工资已经结清；

（3）已经在报纸上发布注销公告（该报纸应为公开发行的报纸）；

4、清算组成员《备案确认通知书》；

5、《指定（委托）书》；

6、营业执照正、副本。

特别提请注意：

1、有分公司的公司申请注销登记时，还应当提交分公司的注销登记证明。

2、建议在登记过程中不要更换被委托人。如被委托人发生变化，请重新提交《指定（委托）书》。

3、如果委托有资格的登记注册代理机构办理，应提交加盖该代理机构公章的代理机构营业执照复印件、《指派函》、《委托书》、代理人员的资格证明及身份证明。

4、注销文件需要股东盖章签字（法人股东盖公章，自然人股东本人签字）；法定代表人本人签字；董事会成员本人签字。

《中华人民共和国公司法》第一百八十八条：

公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。