退耕还林苗木补助方式与补偿标准是：苗木补偿＝年产值耕种季数，按照青苗补偿亩数乘以工程所在地规定的费用标准计算或按占征用土地费用的百分率确定，林木、果树等地上物需要根据树龄、是否在盛果期等因素进行估算。

退耕还林苗木补助标准

国家按退耕还林每亩补助1500元（其中中央财政专项资金安排现金补助1200元、国家发展改革委安排种苗造林费300元）、退耕还草每亩补助1000元（其中中央财政专项资金安排现金补助850元、国家发展改革委安排种苗种草费150元）。

《土地管理法》第四十八条

征收农用地以外的其他土地、地上附着物和青苗等的补偿标准，由省、自治区、直辖市制定。对其中的农村村民住宅，应当按照先补偿后搬迁、居住条件有改善的原则，尊重农村村民意愿，采取重新安排宅基地建房、提供安置房或者货币补偿等方式给予公平、合理的补偿，并对因征收造成的搬迁、临时安置等费用予以补偿，保障农村村民居住的权利和合法的住房财产权益。