农村合作医疗报销比例如下：

1、村卫生室及村中心卫生室就诊报销60％，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元；

2、镇卫生院就诊报销40％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元；

3、二级医院就诊报销30％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元；

4、三级医院就诊报销20％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元；

5、中药发票附上处方每贴限额1元；

6、镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元；

7、特殊病种一个医保年度内，特殊病种门诊免报额度为400元，符合规定治疗范围的医疗费用报销比例与普通住院待遇相同。

二、农村医疗保险报销范围如下：

1、大病报销范围，符合规定的大病医疗费用，以各省基本医疗保险、基本医疗保险医疗服务项目目录为准；

2、住院报销范围，住院报销包括药品报销以及治疗费报销；

3、门诊报销范围，门诊报销包括药品报销以及检查费用报销。

二、农村合作医疗办理流程如下：

1、本人申请并积极缴纳合作医疗款；

2、村委会审核并向镇合管站提交筹资花名册、筹资票据；

3、镇合疗办复查，审核合疗筹资表，向县合疗中心提出申请签证；

4、县合疗经办中心审核无误后，办理签证、盖章、登录，确认。

综上所述，农村合作医疗村卫生室及村中心卫生室就诊报销60％，镇卫生院就诊报销40％，二级医院就诊报销30％，三级医院就诊报销20％。农村医疗保险报销范围是符合规定的大病医疗费用，以各省基本医疗保险、基本医疗保险医疗服务项目目录为准；住院报销包括药品报销以及治疗费报销；门诊报销包括药品报销以及检查费用报销。

农村合作医疗三甲医院报销比例

新农合在三级省医院门诊补偿：

三级医院就诊报销20％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。中药发票附上处方每贴限额1元。

新农合在三级省医院住院补偿：

报销范围：

药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费，限额200元；手术费（参照国家标准，超过1000元的按1000元报销）。

报销比例：三级医院报销30％。

新农合在三级省医院报销程序：

参保者出院后，将经患者本人签字或盖章的住院发票、出院记录、费用清单、转诊证明及本人身份证复印件或户籍证明缴本乡镇合管所，经审核后集中统一送交市农保业务管理中心。

根据我国《社会保险法》第二十八条规定：符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。