对于染色体异常引起的损害，一般来说并不属于重大疾病保险所承保的范畴，故此保险公司可能并不予以理赔。众多保险公司都会在其拟定的合同文本之中明确列举出不承担责任的具体情况，其中便涵盖了遗传性疾病、先天性畸形、变形或者染色体异常等多个方面。这样一来，倘若投保人所面临的疾病正是此类问题，那么依据合同约定，保险公司很有可能会据此决定是否进行理赔。

《中华人民共和国保险法》第十一条：保险合同是当事人订立的文书，保险人应当依照保险合同的约定承担保险责任。