呼和浩特海关全面融入东北地区区域通关一体化改革，将与大连、沈阳、长春、哈尔滨、满洲里等海关建立统一的申报平台，实现外贸企业一地注册、多地报关。

呼和浩特海关推进区域通关改革已具备良好的发展基础。2014年，呼和浩特海关实行属地申报、口岸验放和属地申报、属地放行，进出口货物310万吨，实现翻番增长，适用企业达到33家。为确保有效防范风险，东北地区各海关建立健全区域内企业信息共享机制，实施统一的信用等级差别化管理措施。东北地区直属海关企管部门将设立总协调员岗位，建立协调员联系配合机制，处理解决企业在区域内业务疑难问题。