合伙企业申报生产经营所得的流程如下：

1、在电脑上下载自然人税收管理系统扣缴客户端并安装好；

2、输入公司名称税号及申报密码登录系统；

3、登录页面之后选择左上角的生产经营，点击网上申报，根据填写的信息，系统会自动计算出需要缴税的金额；

4、点击发送申报表，再获取反馈，系统会提示成功申报，然后可以在系统缴款。

一、印花税申报程序（北京为例）：

1、登录北京互联网地税局，选择“纳税申报”模块。

2、选择“明细申报”下的“印花税申报”

3、选择“印花税申报”下的“单笔明细申报”。

4、点击“增加”按钮添加行，逐行录入申报数据，点击“申报”按钮。系统提示“申报成功”信息。

5、打印申报表，点击“操作”栏下的“打印申报表”，点击“打印”按钮。

6、生成税收缴款书，选择“明细申报”下的“税款缴纳（适用于城镇土地使用税、房产税、印花税、资源税、城建税及附加）”。

7、点击“查询”按钮，选择缴税开户银行，勾选需要缴税申报记录的序号，点击“生成缴款书”按钮。系统提示“生成缴款书成功！”信息。点击操作栏下的“打印”按钮。

8、点击打印预览下的“打印”按钮，打印《银行端查询缴税凭证》。

二、小微企业报税流程

1、小微企业人员工资需要向税务部门申报，不管工资有没有超过个人所得税起征点，每个月都要申报，如果没有超过个税起征点就零申报。

2、小微企业报税流程具体如下：申报个人所得税首先要登录本地税务网，在通知公告栏中找到金税三期个人所得税扣缴系统的下载地址，下载完成后，(要插入公司纳税卡)，打开申报系统先要输入资料，首先在人员登记一栏对人员进行登记，如后期添加人员，点击添加即可，登记完成后点击报表填写，也可返回首页进行报表填写。填写完成后点击提交申报按钮，提交申报即可。如果已申报而提交的申报信息有错误需要纠正，那么我们可以点击申报更正，根据提示更正后提交申报即可。