离婚时两个孩子，法院判决的原则如下：

1、夫妻双方就子女抚养达成协议，并按双方意愿出具判决；

2、如果双方不能达成协议，法院将按照一人抚养一个孩子的原则进行判决；

3、判决抚养时，法院会根据孩子的年龄、性别等因素进行判决。

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

夫妻离婚时有两个孩子一般会怎么判决

对于有两个孩子的父母，可以先协商决定孩子抚养权的归属，协商不定时，可以选择通过诉讼的方式争取孩子的抚养权，如果两个孩子都过了哺乳期时，法院一般情况会判决一人一个，这是法院出于经济责任分摊、孩子成长、家长精力这些角度考虑的；如果还在哺乳期，原则上会交由母亲抚养，对方需要给付抚养费。抚养费一般原则上：双方分别抚养一个时，互相不需要给抚养费；如果都是一方抚养，另一方需要每月给抚养费，原则是根据当地生活水平、小孩上学生活需要来定的，一般不超50％月工资收入。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。