一、如何处理发生在单位犯罪中的员工

单位犯罪员工的处理：如果员工属于直接负责的主管人员和其他直接责任人员的，应当判处刑罚；如果不属于直接负责的主管人员和其他直接责任人员的，不需要判处刑罚。

《中华人民共和国刑法》第三十条公司、企业、事业单位、机关、团体实施的危害社会的行为，法律规定为单位犯罪的，应当负刑事责任。

《中华人民共和国刑法》第三十一条单位犯罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。本法分则和其他法律另有规定的，依照规定。

二、单位犯罪员工可以举报吗

员工可以通过向公安机关、检察机关、纪检监察机关等报案、举报公司的犯罪行为，并依据相关法律法规对受举报情况进行调查和处理，保护举报人的合法权益。

《中华人民共和国刑法》第七十七条规定：任何单位和个人发现刑法规定的犯罪行为，有权向公安机关、检察机关、国家安全机关报案或者举报，并提供有关证据材料。

《最高人民检察院、公安部、财政部关于保护、奖励职务犯罪举报人的若干规定》第三条规定：任何单位和个人发现、举报职务犯罪，有权进行举报，并依法获得承办机关的保护，有可能获得举报奖励。

三、单位犯罪的追诉时效

单位犯罪追诉时效的确定标准与自然人追诉时效相同，根据法定最高刑的标准进行确定。根据《刑法》规定，法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年不再追诉。

《中华人民共和国刑法》第八十七条

犯罪经过下列期限不再追诉：

（一）法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；

（二）法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；

（三）法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；

（四）法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。

《中华人民共和国刑法》（2020修正）：第一编　总则 第二章　犯罪 第四节　单位犯罪　　　　第三十一条　单位犯罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。本法分则和其他法律另有规定的，依照规定。