妨碍传染病预防罪应按以下标准处罚

引起甲类传染病，依法确定甲类传染病预防，控制措施的传染病传染或传染危险的，一般对行为者判处3年以下有期徒刑或拘留的结果特别严重的，对行为者判处3年以上7年以下有期徒刑。

结果特别严重是指以下情况之一

（一）供水单位供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的；

（二）根据疾病预防管理机构提出的卫生要求，拒绝对病原体污染的污水、污染物、场所和物品进行消毒处理

（三）准许或者纵容传染病病人，病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的；

（四）出售，运输疫区中被传染病病原体污染或者可能被传染病病原体污染的物品，未进行消毒处理的；

（五）拒绝执行县级以上人民政府，疾病预防管理机构根据传染病预防管理法提出的预防管理措施。