办理房屋的土地使用权证的程序是：

1．由用地者到市国土资源局地籍科填写土地登记申请书；

2．由国土资源局派人到实地调查，全面核实土地登记申请的内容；

3．由国土资源局专职人员对申请登记的土地权属性质、用途权属来源等进行审核；

4．填写土地登记卡、土地归户卡等；

5．申请人凭身份证和土地使用登记收件单，领取土地使用证。

如何办理集体土地使用证

根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四条，农民集体所有的土地，由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。设区的市人民政府可以对市辖区内农民集体所有的土地实行统一登记。

可见，农民集体所有土地用于非农业建设的，才需要给使用权人发给土地使用证，发证机关为县级或者市级土地管理部门。

如何办理集体土地使用证：

一、申请

1、由农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请，领取土地登记申请审批表。

2、提交个人身份证或农村居民户口簿复印件一份。

3、土地权属材料（82年5月14日以前，提交村、队权属来源证明书；82年5月14日以后，提交农村建房使用证；97年4月以后提交农村建房申请书、农村建设用地批准书等）。

二、调查

由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量、申请人现场指界、邻宗地签字盖章，填写地籍调查表，绘制宗地草图。

三、审核

先由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核，审核用地材料是否合法，用地界线是否无争议，用地面积是否准确。

四、审批

经审核符合“用地面积清楚，界址准确，权属合法，无争议”原则的，可批准并进行张榜公布，在公布一个月内无单位或个人对其提出争议的，由县人民政府颁发集体土地使用证。

《中华人民共和国土地管理法》第二条，中华人民共和国实行土地的社会主义公有制，即全民所有制和劳动群众集体所有制，全民所有，即国家所有土地的所有权由国务院代表国家行使，任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地，土地使用权可以依法转让，国家为了公共利益的需要，可以依法对土地实行征收或者征用并给予补偿。