一、存疑不起诉的公职人员处理方式是什么?

存疑不起诉的公职人员处理方式一般是开除其公职，存疑不起诉是检查机关经退回补充侦查后，仍然认为证据不足，而做出的不起诉决定。如果将来收集到足够的证据，检查机关仍然保留起诉的权力，但在那之前，根据“无罪推定”原则，当事人应被视为无罪，不会因此开除公职。但如果将来再度被起诉并判决有罪，会相应被开除公职。

《人民检察院刑事诉讼规则》第405条规定，人民检察院根据刑事诉讼法第171条第四款规定决定不起诉的，在发现新的证据，符合起诉条件的，可以提起公诉。

二、存疑不起诉公务员能受处罚吗

公务员不受到起诉，因为检察院认为其罪行尚不构成犯罪，做出不起诉决定，故而退回有行政单位进行行政处罚。

1.行政处罚是以对违法行为人的惩戒为目的，而不是以实现义务为目的。这一点将它与行政强制执行区别开来。行政强制执行的目的在于促使义务人履行义务。

2.行政处罚的适用主体是行政机关或法律、法规授权的组织。这一点使它与刑罚区别开来。刑罚的适用主体是人民法院。

行政处罚与刑罚的区别：制裁的性质不同;适用的违法行为不同;惩罚程度及适用的程序不同;制裁机关不同;处罚形式不同。

3.行政处罚的适用对象是作为行政相对方的公民、法人或其他组织，属于外部行政行为。这一点将它与行政处分区别开来。行政处分只能适用于行政机关的工作人员或其他由行政机关任命或管理的人员。

行政处罚与行政处分的区别：制裁的对象不同;制裁的行为性质不同;制裁的原则不同;惩罚的范围和程度不同;采取的形式不同;两者的救济途径不同。

4.行政处罚的前提是相对方实施了违反法律规范的行为，而非违反了刑法、民法等其它法律规范的行为。

刑事案件存起不起诉是合法的，但是存疑情形发生时，不得直接将犯罪人员释放，而是需要将案件重新退还到公安机关处继续进行侦查，若是在存疑之后决定不起诉，并且将逮捕的犯罪人员释放，此时存疑不起诉者是会被开除公职的。