对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

一、公诉撤诉的法律规定

《中华人民共和国刑事诉讼法》

第一百七十一条人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十四条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

第一百七十三条犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、行政处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。

二、检察院可以直接撤回起诉的情形

1、不存在犯罪的一个事实。

2、这个犯罪事实并非是被告人所做的。

3、案件的证据并不足，或者是证据发生了一些变化，并不符合起诉条件的。

4、被告人并没有达到刑事责任的年龄，因此不负刑事责任的。

5、被告人是个精神病人，而且并不能变人自己的行为以及不能控制自己的行为，在这个时候，如果造成了危害的结果的话，那么在经过了法定的程序确定之后，它是不需要来负刑事责任的。

6、法律或者是司法解释发生了变化，导致了不应当追求被告人的刑事责任的。

7、其他的一些不应该去追究被告人刑事责任的理由。那么对于人民法院建议人民检察院撤回起诉或者是来你做无罪判决的，那么人民检察院应当认真的去审查，并且去与人民法院来交换各自的意见。