擅自停工的，应当按照合同约定承担违约责任，并赔偿发包人的相关损失。如果暴雨是不可抗力的自然灾害，承包商停止工作是可以理解的，双方可以按照以下方式处理赔偿事项：

1、工程本身的损害，因工程损害造成的第三方人员伤亡和财产损失，以及运输到施工现场的材料和待安装设备的损坏，由业主承担；

2、发包人、承包人的人员伤亡由其所属单位负责，并承担相应费用；

3、施工单位应承担施工单位机械、设备损坏、停工等损失。

合同违约应如何索赔违约金

合同违约，可以根据合同约定向违约方索要违约金。如果产生纠纷，可以提起民事诉讼。

根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条第一款、第二款的规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

《中华人民共和国建筑法》第七十条违反本法规定，涉及建筑主体或者承重结构变动的装修工程擅自施工的，责令改正，处以罚款；造成损失的，承担赔偿责任；构成犯罪的，依法追究刑事责任。