不同的案件可以起诉同公司，根据《民事诉讼法》第一百一十九条的规定，起诉必须符合下列条件：

（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；

（二）有明确的被告；

（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；

（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。

一、合并审理的情况

1、须有两个或两个以上独立之诉。每个独立之诉包含诉讼主体、诉讼标的和诉的理由三要素。

2、各独立之诉在诉讼标的或法律事实之间具有一定的关联性。

3、具有相关联的各独立之诉均属民事案件，均由同一法院管辖。

4、一个独立之诉起诉到法院后，其他独立之诉的主体向同一法院主张要求一并处理的案件。

二、总公司违法可以起诉分公司

分公司是总公司下属的直接从事业务经营活动的分支机构或附属机构。虽然分公司有公司字样，但它不是真正意义上的公司。因为分公司不具有企业法人资格，不具有独立的法律地位，不独立承担民事责任。所以分公司违法就相当于总公司违法，而且你也只能起诉总公司，分公司根本既没有法人资格。

母公司、子公司各为独立的法人。法律上，子公司是具有法人地位的独立公司企业，它有自己的公司名称和公司章程，并以自己的名义进行经营活动，其财产与母公司的财产彼此独立，各有自己的资产负债表。在财产责任上，子公司和母公司也各以自己所有财产为限承担各自的财产责任，互不连带。理论上应该是那个公司违法起诉那个公司，和另外一个公司没有必然联系。