一、股东投资款超过实收资本要如何处理

公司股东投资超过实收资本金部分可以转做留存收益入账，即留存收益＝资本公积－资本溢价，还要去工商局申请公司增资，办理相应的手续。公司的股东资本金投入大于实收资本，可以作两种处理，一是在没有任何约定的情况下，超出部分作为股东对公司的债权，二是股东溢价出资，超出部分作为资本公积。

《中华人民共和国公司法》第一百六十七条

，股份有限公司以超过股票票面金额的发行价格发行股份所得的溢价款以及国务院财政部门规定列入资本公积金的其他收入，应当列为公司资本公积金。

二、股东出资不实的要如何处理

股东出资不实，经催告后在合理期限内仍不履行缴纳出资义务的，在此种情况下，公司作为债权人，可在“公司出资纠纷”诉讼中直接起诉瑕疵出资的股东承担其对应法律责任。

《公司法》第二十八条：股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东以货币出资的，应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户；以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。股东不按照前款规定缴纳出资的，除应当向公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。

第三十条：有限责任公司成立后，发现作为设立公司出资的非货币财产的实际价额显著低于公司章程所定价额的，应当由交付该出资的股东补足其差额；公司设立时的其他股东承担连带责任。

《中华人民共和国公司法》（2018修正）：第二章　有限责任公司的设立和组织机构 第一节　设　　立　　第三十条　有限责任公司成立后，发现作为设立公司出资的非货币财产的实际价额显著低于公司章程所定价额的，应当由交付该出资的股东补足其差额；公司设立时的其他股东承担连带责任。