闯两次红灯扣12分不能代消分。代消分这种行为是违法的，经过工作人员的查实后，不仅会拒绝为车主办理业务，还会对代车主消分的人进行处罚，一般是处2000元的罚款，并且扣12分。车主可以先处理一次闯红灯的违章行为，然后参加学法减分的活动来消除6分，然后再处理另一次闯红灯的违章行为。这样就不用重新参加科目一的学习，也不会影响驾驶证的使用。

用别人的驾驶证扣分会被认定为“买卖分”，将会受到相应的惩罚。首次会被处以罚款：代替实际驾驶人接受机动车交通违法处罚和记分并从中牟取经济利益，暂扣6个月机动车驾驶证并处以罚款。再犯会被处以拘留：代替实际驾驶人接受机动车交通违法处罚和记分并从中牟取经济利益，被处罚后再犯，以及组织、介绍它人代替实际驾驶人接受机动车交通违法处罚和记分并从中牟取经济利益，处十五日以下拘留；吊销机动车驾驶证，五年内不得重新取得机动车驾驶证。违法所得，予以没收。

法律依据：《机动车驾驶证申领和使用规定》第七十一条

公安机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，除依法给予行政处罚外，实行道路交通安全违法行为累积记分制度，记分周期为12个月，满分为12分。

机动车驾驶人在一个记分周期内记分达到12分的，应当按规定参加学习、考试。

闯红灯扣12分怎么消分

先到机动车驾驶证核发地或者驾驶员违法行为地的公安机关交通管理部门，接受为期7天，每天8个学时的道路交通安全法规和相关知识培训。然后重新参加科目一考试，考试合格后，记分将被清零，并发还机动车驾驶证，考试不合格的驾驶员，就需重新参加学习和考试。根据相关法律规定，对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，处罚与记分同时执行。机动车驾驶人一次有两个以上违法行为记分的，应当分别计算，累加分值。