一、农民承包的土地流转后，还能确权吗?

可以，农村土地流转是指将经营权转让给其他人的行为，土地流转转让的是经营权，而不是使用权，所以并不影响以包人对土地的确权。

相关法律规定：

《农村土地承包经营权流转管理办法》：

第三条农村土地承包经营权流转不得改变承包土地的农业用途，流转期限不得超过承包期的剩余期限，不得损害利害关系人和农村集体经济组织的合法权益。

第十五条承包方依法取得的农村土地承包经营权可以采取转包、出租、互换、转让或者其他符合有关法律和国家政策规定的方式流转。

第十六条承包方依法采取转包、出租、入股方式将农村土地承包经营权部分或者全部流转的，承包方与发包方的承包关系不变，双方享有的权利和承担的义务不变。

第十七条同一集体经济组织的承包方之间自愿将土地承包经营权进行互换，双方对互换土地原享有的承包权利和承担的义务也相应互换，当事人可以要求办理农村土地承包经营权证变更登记手续。

第十八条承包方采取转让方式流转农村土地承包经营权的，经发包方同意后，当事人可以要求及时办理农村土地承包经营权证变更、注销或重发手续。

二、土地承包经营权流转的程序是怎样的?

(一)农户自主流转其承包经营权的，按以下程序办理：

1、流转双方洽谈磋商，认定流转方式、流转时间、流转价格以及流转收益支付方式等。

2、流转双方在协商一致的基础上签订书面合同，由流转双方本人签章。

3、流转合同签订后，承包农户应将签字后的土地承包经营权流转合同分别报送土地发包方和所在乡(镇、街道)农村土地流转服务中心存档。

4、土地发包方和乡(镇、街道)农村土地承包经营权流转服务中心收到承包农户递交的书面流转合同后，应当予以必要的审核，如有不妥应给予指正。如发现违背国家法律法规的，应依法予以制止。

(二)农户委托村集体流转其承包经营权的，按以下程序办理：

1、农户递交由户主签字的委托流转申请书。

2、乡(镇、街道)、村农村土地承包经营权流转服务机构分别进行审核，讨论是否接受委托，并将讨论结果在半个月内通知委托农户。

3、如决定接受委托的，村集体应当与委托农户签订委托合同，并在接受委托后半个月内，将流转农户、地块等基本情况，以适当形式向村内外发布公告，并上报县、乡(镇、街道)农村土地承包经营权流转机构，对外发布。

4、有意受让流转土地的，可在县、乡(镇、街道)、村农村土地承包经营权流转机构公告的有效期内，提交受让流转土地的规划书面申请。

5、县、乡(镇、街道)、村农村土地承包经营权流转机构在公告期结束后，及时召集已提交受让流转土地的申请人进行磋商。可以协商确定流转价格，也可以通过招标的办法确定流转价格，在公平合理、协商一致的基础上拟订流转合同草案，经委托人(承包户)与业主签字认可后正式生效。

农村土地承包经营权的承包必须是双反出于主观自愿而进行的，如果一方采用胁迫手段逼迫对方订立承包经营合同的，另一方可以在合同订立之后向人民法院提起诉讼，请求人民法院判决认定该承包经营合同无效，或者是直接撤销该承包经营合同。