交通事故对方住院的赔偿是根据双方的主次责任来确定的，具体如下：

1、事故双方均为机动车的，双方在交强险额度内全额互相赔偿对方损失，死亡伤残11万、医疗费1万元、财产2000元；不足部分，双方按7：3的比例分担；

2、事故一方为机动车，一方为非机动车或者行人的，机动车在交强险额度内全额赔偿对方损失，不足部分，如果机动车占主要责任，主次责任按8：2分担，如果机动车占次要责任，主次责任按6：4分担；

3、双方均为非机动车或者行人的，所有损失按7：3比例分担。对方车辆的保险公司根据事故责任和具体的损失等实际情况进行赔偿：

1、首先应该由保险公司根据事故的责任，在交强险赔偿限额内全额赔偿伤者的医疗费、误工费、护理费、营养费、交通费、住院伙食补助费等，如果构成残疾的，还应该根据伤残等级赔偿相应的残疾赔偿金、精神抚慰金、残疾辅助器具费等。

2、如果经交强险赔偿后尚有不足的，对于不足部分，则可由承包对方车辆第三者责任险的保险公司在赔偿限额内，按责任比例进行赔偿。当然，也可以由对方先行赔偿后，再由对方自行向保险公司申请理赔。