特殊机构赋码办理流程如下：

1、如需开立外汇帐户，其开户申请书应是正式公函，必须盖有单位公章，申请内容明确，开户申请书中必须写明外汇资金来源、用途情况，开户银行，开户币种，如是专项帐户还需说明项目及有关情况及开户期限，以及外汇局要求提供的其他材料；

2、开户需持外汇局要求的有关材料的正本及其复印件；

3、接受捐赠或援助的单位必须是国内民间组织、科研院所、大专院校等国内事业单位，并按捐赠或援助协议规定将捐赠款项用于境外支付。

特殊机构赋码证是什么

特殊机构是指目前不属于全国组织机构代码管理中心赋予正式组织机构代码范围的、确因办理收支业务需要统一标识的申报机构，包括部分境内机构（军队、武警等），以及在境内银行有收支业务的境外机构（包括香港、澳门、台湾的机构，以下简称境外机构）、驻华使领馆和国际组织驻华机构等。特殊机构代码是指全国组织机构代码管理中心向特殊机构统一赋予的、仅供该机构在办理国际收支申报时使用的专用代码。该代码不作为认可特殊机构为有效机构的证明。

《组织机构代码管理办法》第三条本办法所称组织机构，是指依法设立的机关、企业、事业单位，社会团体以及其他组织机构。

本办法所称组织机构代码，是指根据代码编制规则编制，赋予每一个组织机构在全国范围内唯一的、始终不变的识别标识码。

本办法所称组织机构代码证书，是指组织机构代码识别标识的载体和法定凭证，分为正本和副本；正本为纸质证书，副本包括纸质证书和电子证书。