1、承包人主张预付款、进度款，其诉讼时效为按合同约定的支付期限提出付款要求后二年。

2、承包人主张工程结算款，其诉讼时效自工程通过工程竣工质量验收、承包人提交竣工结算报告后二年，为发包人工程价款的确认时效，如工程价款结算已经确定，自确认之日后二年为承包人的返还时效，如承包人送出工程价款结算报告，发包人在二年未确认结算款，承包人的返还时效最长为4年。

3、承包人主张签证、索赔增加的工程款，诉讼时效为提交签证、索赔资料后二年；如合同约定除斥期间的，除斥期间届满，当事人丧失时效。

一、建筑工程合同有诉讼时效吗

就建筑工程合同产生的纠纷有诉讼时效，且依据我国《民法典》的相关规定其时效期限一般为三年。建设工程合同也称建设工程承发包合同，是指由承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。建设工程合同包括三种：即建设工程勘察合同、建设工程设计合同、建设工程施工合同。

二、建设工程合同工期涉及诉讼时效的相关问题

1、工期为工程开工至竣工的期间。

工程开工，分为计划开工日期（指合同约定的开工日期）和实际开工日期（指工程符合开工条件，承包人提请开工报告，发包人下达的开工通知或开工令载明的开工日期。由于符合开工条件主要指发包人已获得主管部门的施工许可证，故，实际开工日期通常会比合同约定的开工日期晚。）

工程竣工，是指工程合同约定的承包范围由施工图纸所载明的工程内容已经完工，竣工也有计划竣工日期和实际竣工日期的区别，合同计划开工日期顺延，计划竣工日期相应顺延。

2、在施工过程中承包人要求工期顺延，或施工合同约定有形象进度节点工期的，发包人主张节点工期延迟，诉讼时效为当事人提出工期顺延或工期迟延签证申请后二年，如工期争议涉及工程质量缺陷的，诉讼时效为质量缺陷鉴定出具意见后二年。

3、工程竣工后，发包人主张承包人逾期竣工，诉讼时效为工程实际竣工之日后二年，如合同约定发包人提出逾期竣工主张有除斥期间的，除斥期限届满丧失时效。